Le Centre de documentation égyptologique est créé en 1946 par Jean Sainte Fare Garnot. Peu après, entre 1946 et 1947, une importante donation de livres et d'archives de l'égyptologue Wladimir Golenischeff enrichit la bibliothèque, qui prend alors son nom. En 1952, le Centre et la bibliothèque s'installent au 19 avenue de Iéna, dans le 16e arrondissement de Paris, dans les locaux du Musée Guimet.
En 1992, à la suite de la fermeture du Musée Guimet pour travaux, le Centre est contraint de...
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Le Centre de documentation égyptologique est créé en 1946 par Jean Sainte Fare Garnot. Peu après, entre 1946 et 1947, une importante donation de livres et d'archives de l'égyptologue Wladimir Golenischeff enrichit la bibliothèque, qui prend alors son nom. En 1952, le Centre et la bibliothèque s'installent au 19 avenue de Iéna, dans le 16e arrondissement de Paris, dans les locaux du Musée Guimet.
En 1992, à la suite de la fermeture du Musée Guimet pour travaux, le Centre est contraint de déposer ses collections dans des locaux privés et un garde-livres. Trois ans plus tard, en 1995, il est relogé au 29 rue Daviel, dans le 13e arrondissement. En 2008, le Centre est intégré au Service Commun de la Documentation (SCD) de l'EPHE, qui devient ensuite le Service commun de la documentation, des bibliothèques et des archives (SCDBA). À cette occasion, une partie des archives de Marie-Alphonse Dain, incluse dans celles de Jean Yoyotte (décédé en 2009), est intégrée aux fonds du Centre. Christiane Zivie-Coche, alors directrice du Centre, souligne la réception de ces documents.
En 2011, après un hébergement temporaire à la Porte de la Chapelle, le Centre déménage dans le bâtiment Le France, au 190 avenue de France, toujours dans le 13e arrondissement. En 2019, les archives rejoignent l’Humathèque Condorcet, sur le Campus Condorcet.